学校现有学前教育学院、艺术学院、机电工程学院、建筑工程学院、经济管理学院、文化旅游学院、信息工程学院、继续教育学院、护理学院、师范学院、农业经济技术学院、航海学院、中专部、公共教学部等14个院系部,开设了40多个专业。包括电子信息工程、机电一体化、护理、农学、工程造价、建筑工程技术、数控技术、涉外贸易、工商管理、市场营销、计算机系有计算机应用、计算机网络与管理和数据库管理、广告装璜、商务英语、旅游英语、语文教育、美术教育、计算机教育、学前教育、国际邮轮乘务等。新的九江职业大学已经成为一所集工科、经贸、外语、人文、中小学教育、学前教育、护理、农学等九十多个专业的综合性的新型高等职业院校。